1970 yılında Konya'nın Çumra İlçesinde doğdu. İlk ve orta öğrenimini Çumra'da, Liseyi Konya'da bitirdi. 1995 yılında Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi Kamu Yönetimi Bölümünden mezun oldu. 1996 yılında İçişleri Bakanlığının açmış olduğu Kaymakam Adaylığı sınavını kazanarak Konya Kaymakam Adayı olarak göreve başladı. 1998 yılında 8 ay süreyle  İngiltere'ye gitti. 1999 yılında Milli Güvenlik Akademisinden mezun oldu. Aksaray-Gülağaç, Erzurum-Tekman, Nevşehir-Derinkuyu ve Bitlis-Adilcevaz İlçelerinde Kaymakamlık yaptı. 2007 Yılında Selçuk Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Kamu Yönetimi Ana Bilim Dalı Kamu Yönetimi Bölümünde Yüksek Lisans çalışmasını tamamladı.  Kaman Kaymakamı olarak görevine devam eden Çiftçi, 2011 yılında da Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesini  bitirdi.Halen A. Ü. Adalet Bölümünde okuyan ve Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Kamu Yönetimi Ana Bilim Dalında başka bir yüksek lisans çalışmasını sürdüren Mustafa ÇİFTÇİ, İngilizce biliyor. Evli ve üç çocuk babasıdır.